江苏省特色水产繁育工程实验室2011年经江苏省发展改革委员会批准成立，该实验室由淮阴师范学院生命科学学院，并联合中国科学院水生生物研究所淮安研究中心、淮安市水产技术指导站、洪泽县水产良种场、新大运生态农业开发公司等单位共同建设。

实验室紧紧围绕特色水产繁育开展研究工作，主要任务是开展特色水产品增养殖技术、种苗工程、营养与病害防治等技术研发与产业化示范，提升江苏特色水产核心竞争力。

实验室科研人员结构合理，学历和职称层次较高。研究团队现有专职研发人员29人，其中教授（研究员）6人，副教授（高级工程师、副研究员）7人，具有博士学位13人，团队中，有中科院“百人计划”人才1人。

实验室拥有室内激光共聚焦显微镜、电感耦合等离子体发射光谱仪-ICP、傅立叶变换红外光谱仪-FTIR、核磁共振波谱仪（NMR）、台式高速冷冻离心机、基因扩增仪、室内循环水养殖系统、孵化系统等大中型仪器和设备，并拥有1000亩水产养殖基地。